制冷与低温工程系前身是合肥工业大学制冷与热工流体教研室，2008机械与汽车工程学院二级机构调整后单独设系，2016年划归新组建的6163银河线路检测中心管理。1989年开始招收四年制本科生，迄今已经培养本科生900余人，1998年获得制冷及低温工程二级学科硕士学位授予权。本专业现有教授1人、副教授 4人、讲师7人，其中具有博士学位教师7人，100%具有硕士学位，已形成一支以中青年学术骨干为主体的结构合理、实力雄厚、勇于开拓创新的高水平的师资队伍。
近年来，制冷与低温学科连续获得国家自然科学基金、省科技厅科技攻关项目、省自然科学基金和企业委托重大科技攻关项目的支持，取得了丰硕的研究成果。该学科是目前安徽省唯一的制冷与低温技术高级人才培养基地，在汽车及运载工具空调设计制造、强化传热和冷却散热技术、低温生物医学工程、冷冻保鲜和冷链物流等方面形成了鲜明的人材培养和研究特色。
该学科紧跟市场发展需要，坚持以制冷家电、能源环境、低温应用技术等重要支柱产业为发展先导，注重基础研究和工程应用的结合，重视与企业的技术合作，先后与多家国内著名科研机构和企业建立了广泛的合作关系，形成了产学研一体化的发展态势。同时，该专业密切结合近年来蓬勃发展的制冷家电制造业，不断改进人材培养模式，注重专业基础和动手能力的培养，毕业的本科生和研究生受到用人单位的广泛好评，平均就业率稳定在98%以上。
